Золотые купола химии
Вход

Забыли пароль?

Поиск
 
 

Результаты :
 

 


Rechercher Расширенный поиск

Новое меню
Меню сайта
Последние темы
» The Elements Spectra 1.0.6 - Русская версия
Чт Июл 12, 2018 1:47 pm автор Serg-Kh

» Строение вещества
Пн Апр 23, 2018 2:53 pm автор эл

» Формулы Периодического Закона химических элементов
Сб Мар 31, 2018 6:27 pm автор sengukim

» Лурье Ю.Ю. - Справочник по аналитической химии
Вс Мар 25, 2018 5:42 pm автор АлисаМалиса

» Видеоурок по химии.Мыло и моющие вещества
Сб Мар 24, 2018 11:14 pm автор vella

» задача
Пн Мар 19, 2018 7:10 pm автор Tem

» превращения веществ
Пт Мар 16, 2018 4:10 am автор Кщьштштш

» Задачка по химии
Чт Мар 15, 2018 4:53 pm автор Sanchous

» Генрих Штремплер.Видео "Учебный эксперимент по химии"
Ср Янв 17, 2018 2:52 am автор Генрих Штремплер

»  Генрих Штремплер.Видео "Учебный эксперимент по химии"
Ср Янв 17, 2018 2:49 am автор Генрих Штремплер

» Нижник Я.П.Лекция 11 "Альдегиды и кетоны"
Чт Янв 11, 2018 11:42 pm автор vella

» Нижник Я.П. Лекция №4: "Непредельные углеводороды.Алкены"
Чт Янв 11, 2018 11:37 pm автор vella

» Нижник Я.П.Лекция 5 .Алкадиены и алкины
Чт Янв 11, 2018 11:34 pm автор vella

»  Нижник Я.П.Лекция 7. Арены-ароматические углеводороды
Чт Янв 11, 2018 11:30 pm автор vella

»  Нижник Я.П.Лекция 8:"Галогенпроизводные углеводородов"
Чт Янв 11, 2018 11:26 pm автор vella

»  Нижник Я.П.Лекция 9:"Спирты"
Чт Янв 11, 2018 11:23 pm автор vella

»  Нижник Я.П.Лекция 10 :"Фенолы.Простые эфиры"
Чт Янв 11, 2018 11:19 pm автор vella

» Нижник Я.П. Лекция №3 "Углеводороды.Алканы"
Чт Янв 11, 2018 11:14 pm автор vella

» Нижник Я.П.Лекция 6.Циклические соединения
Пн Янв 08, 2018 6:41 am автор Likia

» Строение атома.
Сб Дек 30, 2017 11:33 am автор vella

» превращения веществ
Сб Окт 14, 2017 8:47 pm автор dbnzq1

» Хочу найти ответ на свой вопрос в старых темах
Сб Окт 14, 2017 8:43 pm автор dbnzq1

» "Интеграл" серия - "Эколог"
Чт Окт 12, 2017 12:53 pm автор sherzatikmatov

»    Академия занимательных наук.Химия(часть 47).Химический источник тока. Процесс электролиза.
Чт Окт 12, 2017 3:41 am автор Irino4ka

» Научный проект:"Радуга химических реакций"
Чт Окт 12, 2017 2:09 am автор Irino4ka

» Помогите найти программу!
Вт Окт 03, 2017 2:13 pm автор flopi

» Онлайн калькулятор определения степеней оксиления элементов в соединение
Сб Сен 16, 2017 10:58 am автор кардинал

» MarvinSketch 5.1.3.2
Пн Сен 11, 2017 5:26 pm автор кардинал

» Carlson.Civil.Suite.2017.160728
Вт Июл 18, 2017 6:42 pm автор кузбасс42

» Ищу "Химический тренажер" Нентвиг, Кройдер, Моргенштерн Москва, Мир, 1986
Чт Июн 01, 2017 1:58 am автор кардинал

» Губчук Д.П. Итоговая контрольная работа по химии 9 класс
Вс Май 14, 2017 6:12 pm автор школьник

» EXPO2013
Чт Май 04, 2017 10:15 pm автор кардинал

» Е. А. Стрельцов Тесты по химии для поступающих в высшие учебные заведения
Пн Апр 10, 2017 12:31 am автор кардинал

» задача по потенциометрии, запуталась
Вс Апр 02, 2017 6:22 am автор Роксанана

» Бернтсен А.Краткій учебнікъ органической химіи
Пн Мар 13, 2017 10:27 pm автор vella

» Игра :"Химическая защита"
Пн Мар 13, 2017 10:14 pm автор vella

» IsisDraw 1.2
Вс Мар 12, 2017 1:49 am автор Сергей7452

» запутался с решением)
Сб Мар 04, 2017 12:34 am автор Tem

» задачи
Пн Фев 27, 2017 6:57 am автор Tem

» Многоатомные спирты
Чт Фев 23, 2017 1:17 am автор эл

» Запрос
Ср Фев 22, 2017 7:01 pm автор Admin

» Химия. Тесты для самоконтроля
Вт Фев 21, 2017 2:17 pm автор Aktam28.06

» Тест по теме"Предельные углеводороды" с ответами
Сб Фев 18, 2017 9:46 pm автор vella

» Тест по теме"Ароматические углеводороды" с ответами
Сб Фев 18, 2017 9:33 pm автор vella

» Межрегиональная предметная олимпиада Казанского федерального университета по предмету «Химия».2013-2014 уч.год
Сб Фев 18, 2017 11:55 am автор Aktam28.06

» Халиуллин Р.Ш. и др. Олимпиадные задания по предмету "Химия"
Сб Фев 18, 2017 2:16 am автор Aktam28.06

» Gemcom.Surpac.v6.5.1
Сб Фев 11, 2017 6:42 am автор PRIZ

» FX ChemStruct 1.105 - Русская версия
Чт Фев 09, 2017 5:44 pm автор vella

» Троегубова Н.П.Контрольно-измерительные материалы. Химия. 11 класс
Пн Фев 06, 2017 7:59 pm автор Fallen

» Тест по теме Спирты и фенолы
Ср Янв 25, 2017 9:06 pm автор кардинал

Часы и календарь
гороскоп
Кто сейчас на форуме
Сейчас посетителей на форуме: 19, из них зарегистрированных: 0, скрытых: 0 и гостей: 19 :: 1 поисковая система

Нет

Больше всего посетителей (799) здесь было Ср Фев 15, 2012 9:20 pm
Страны
Статистика
Всего зарегистрированных пользователей: 44170
Последний зарегистрированный пользователь: Татьяна Долгих

Наши пользователи оставили сообщений: 14490 в 9527 сюжете(ах)
Самые активные пользователи
vella (2577)
 
Admin (1989)
 
кардинал (1918)
 
Rus (1489)
 
Линда (1192)
 
Deza (645)
 
robert (471)
 
alhimik (278)
 
Shushi (236)
 
Oxygenium (185)
 

Счётчик от яндекса
Яндекс.Метрика
популярные пользователи


mMass - Open Source Mass Spectrometry Tool

Перейти вниз

mMass - Open Source Mass Spectrometry Tool

Сообщение автор кардинал в Вс Мар 21, 2010 5:37 pm

[Вы должны быть зарегистрированы и подключены, чтобы видеть это изображение]

mMass принадлежит к широкий семье программного обеспечения с открытым исходным кодом.
Она написана на Python языке, использует wxPython библиотеки графического пользовательского интерфейса и выпущен под лицензией GNU General Public License .

[Вы должны быть зарегистрированы и подключены, чтобы видеть это изображение]

Поддержка форматов

mMass поддерживает несколько масс-спектрометрических форматов, такие как mzData и mzXML . Масс-спектры или peaklist данные также могут быть легко импортированы из простых ASCII файлов, состоящий из двух столбцов (м / г значения и интенсивности), разделенных вкладкой, пробелом, запятой или точкой с запятой. Кроме того, есть поддержка родного данные Bruker Daltonic Flex документов Series.
Одной из популярных функций mMass является возможность открыть пустой документ и создать peaklist вручную.

Обработка данных

[Вы должны быть зарегистрированы и подключены, чтобы видеть это изображение]

Наконец, есть функции обработки данных, таких как автоматический сбор пиков, deisotoping, коррекция базовой линии и сглаживания.


Калибровка

[Вы должны быть зарегистрированы и подключены, чтобы видеть это изображение]

Два из них будут доступны для калибровки данных. Внутренняя калибровка является классическим методом калибровки,связанная с  использованием внутренних эталонных значений.
Статистическая калибровки, которую иногда называют самокалибровкой, является особым методом, доступным для пептидных масс-спектров.


Последовательность инструментов

[Вы должны быть зарегистрированы и подключены, чтобы видеть это изображение]

mMass обеспечивает внутреннюю последовательность c помощью редактора. Любые изменения могут быть применены в качестве фиксированной или переменной. Protein Digest инструмент может быть использован для создания списка пептидов  в Silico . Кроме того, пептид фрагментация инструмент формирует список общих фрагментов пептида. В обоих случаях все возможные комбинации переменных  рассчитываются и результат может быть легко сопоставим с данными измерений.


Mass Calculator

[Вы должны быть зарегистрированы и подключены, чтобы видеть это изображение]

Mass Calculator инструмент может быть использован для моделирования изотопной структуры данной формулы и генерированием профиля спектра ,который можно легко сравнить с реальными данными.


Поиск

[Вы должны быть зарегистрированы и подключены, чтобы видеть это изображение]

Поисковый инструмент может быть использован для поиска любого указанного пользователем соединения в спектре. Каждое соединение определяется как молекулярная формула, поэтому оба моноизотопный или средней массы можно найти.


Пик различий

[Вы должны быть зарегистрированы и подключены, чтобы видеть это изображение]

Интерпретациямасс-спектров как правило, включает нескончаемым проверки различий между всеми пиками  в спектре. Однако Peak Differences tool может просто создать таблицу всех различий между пиками в peaklist. Эта таблица может быть использован для автоматического сравнения, в пределах допуска, каждое отличие от соответствующих масс всех аминокислот, рассчитанных дипептидов или заданного значения массы.


Поиск Mascot

[Вы должны быть зарегистрированы и подключены, чтобы видеть это изображение]

Хотя масс-спектрометрия является очень популярным инструментом для идентификации белков, оно не  возможно без инструментов в открытом доступе на on-лайн. MMass предоставляет интерфейс, который позволяет получать данные непосредственно направленые на три основных инструмента, доступные на сайте Mascot; Peptide Mass Fingerprint, Sequence Query and MS/MS Ion Search.


И многое другое ...

Официальный сайт: [Вы должны быть зарегистрированы и подключены, чтобы видеть эту ссылку]

Скачать version 3.2.0 for MS Windows(17,5 MB):

[Вы должны быть зарегистрированы и подключены, чтобы видеть эту ссылку]

For Mac OSX(32,6 MB):

[Вы должны быть зарегистрированы и подключены, чтобы видеть эту ссылку]
avatar
кардинал
Модератор
Модератор

Сообщения : 1918
Дата регистрации : 2009-08-10
Место жительства : Из далека...

Вернуться к началу Перейти вниз

Re: mMass - Open Source Mass Spectrometry Tool

Сообщение автор Жаворонок в Пт Янв 28, 2011 8:40 pm

Здравствуйте, не подскажете как открывать файлы в программе. При открытии XML формата программа пишет - не тот формат. В чем проблема?

Жаворонок
новичок

Сообщения : 6
Дата регистрации : 2010-10-20
Место жительства : Казань
Возраст : 29

Вернуться к началу Перейти вниз

Re: mMass - Open Source Mass Spectrometry Tool

Сообщение автор vella в Пт Янв 28, 2011 9:01 pm

Уважаемый,Жаворонок
Всё верно-надо внимательно читать аннотацию к программе:

Она написана на Python языке...
С которым можно ознакомиться на нашем сайте :

[Вы должны быть зарегистрированы и подключены, чтобы видеть эту ссылку]

И скачать необходимые приложения для просмотра ваших файлов
avatar
vella
VIP
VIP

Сообщения : 2577
Дата регистрации : 2009-09-06

Вернуться к началу Перейти вниз

Re: mMass - Open Source Mass Spectrometry Tool

Сообщение автор Жаворонок в Вс Янв 30, 2011 1:52 am

СПС.

Жаворонок
новичок

Сообщения : 6
Дата регистрации : 2010-10-20
Место жительства : Казань
Возраст : 29

Вернуться к началу Перейти вниз

Re: mMass - Open Source Mass Spectrometry Tool

Сообщение автор Спонсируемый контент


Спонсируемый контент


Вернуться к началу Перейти вниз

Вернуться к началу


 
Права доступа к этому форуму:
Вы не можете отвечать на сообщения