Золотые купола химии
Вход

Забыли пароль?

Поиск
 
 

Результаты :
 

 


Rechercher Расширенный поиск

Новое меню
Меню сайта
Последние темы
» The Elements Spectra 1.0.6 - Русская версия
Ср Авг 01, 2018 11:19 pm автор Admin

» Строение вещества
Пн Апр 23, 2018 2:53 pm автор эл

» Формулы Периодического Закона химических элементов
Сб Мар 31, 2018 6:27 pm автор sengukim

» Лурье Ю.Ю. - Справочник по аналитической химии
Вс Мар 25, 2018 5:42 pm автор АлисаМалиса

» Видеоурок по химии.Мыло и моющие вещества
Сб Мар 24, 2018 11:14 pm автор vella

» задача
Пн Мар 19, 2018 7:10 pm автор Tem

» превращения веществ
Пт Мар 16, 2018 4:10 am автор Кщьштштш

» Задачка по химии
Чт Мар 15, 2018 4:53 pm автор Sanchous

» Генрих Штремплер.Видео "Учебный эксперимент по химии"
Ср Янв 17, 2018 2:52 am автор Генрих Штремплер

»  Генрих Штремплер.Видео "Учебный эксперимент по химии"
Ср Янв 17, 2018 2:49 am автор Генрих Штремплер

» Нижник Я.П.Лекция 11 "Альдегиды и кетоны"
Чт Янв 11, 2018 11:42 pm автор vella

» Нижник Я.П. Лекция №4: "Непредельные углеводороды.Алкены"
Чт Янв 11, 2018 11:37 pm автор vella

» Нижник Я.П.Лекция 5 .Алкадиены и алкины
Чт Янв 11, 2018 11:34 pm автор vella

»  Нижник Я.П.Лекция 7. Арены-ароматические углеводороды
Чт Янв 11, 2018 11:30 pm автор vella

»  Нижник Я.П.Лекция 8:"Галогенпроизводные углеводородов"
Чт Янв 11, 2018 11:26 pm автор vella

»  Нижник Я.П.Лекция 9:"Спирты"
Чт Янв 11, 2018 11:23 pm автор vella

»  Нижник Я.П.Лекция 10 :"Фенолы.Простые эфиры"
Чт Янв 11, 2018 11:19 pm автор vella

» Нижник Я.П. Лекция №3 "Углеводороды.Алканы"
Чт Янв 11, 2018 11:14 pm автор vella

» Нижник Я.П.Лекция 6.Циклические соединения
Пн Янв 08, 2018 6:41 am автор Likia

» Строение атома.
Сб Дек 30, 2017 11:33 am автор vella

» превращения веществ
Сб Окт 14, 2017 8:47 pm автор dbnzq1

» Хочу найти ответ на свой вопрос в старых темах
Сб Окт 14, 2017 8:43 pm автор dbnzq1

» "Интеграл" серия - "Эколог"
Чт Окт 12, 2017 12:53 pm автор sherzatikmatov

»    Академия занимательных наук.Химия(часть 47).Химический источник тока. Процесс электролиза.
Чт Окт 12, 2017 3:41 am автор Irino4ka

» Научный проект:"Радуга химических реакций"
Чт Окт 12, 2017 2:09 am автор Irino4ka

» Помогите найти программу!
Вт Окт 03, 2017 2:13 pm автор flopi

» Онлайн калькулятор определения степеней оксиления элементов в соединение
Сб Сен 16, 2017 10:58 am автор кардинал

» MarvinSketch 5.1.3.2
Пн Сен 11, 2017 5:26 pm автор кардинал

» Carlson.Civil.Suite.2017.160728
Вт Июл 18, 2017 6:42 pm автор кузбасс42

» Ищу "Химический тренажер" Нентвиг, Кройдер, Моргенштерн Москва, Мир, 1986
Чт Июн 01, 2017 1:58 am автор кардинал

» Губчук Д.П. Итоговая контрольная работа по химии 9 класс
Вс Май 14, 2017 6:12 pm автор школьник

» EXPO2013
Чт Май 04, 2017 10:15 pm автор кардинал

» Е. А. Стрельцов Тесты по химии для поступающих в высшие учебные заведения
Пн Апр 10, 2017 12:31 am автор кардинал

» задача по потенциометрии, запуталась
Вс Апр 02, 2017 6:22 am автор Роксанана

» Бернтсен А.Краткій учебнікъ органической химіи
Пн Мар 13, 2017 10:27 pm автор vella

» Игра :"Химическая защита"
Пн Мар 13, 2017 10:14 pm автор vella

» IsisDraw 1.2
Вс Мар 12, 2017 1:49 am автор Сергей7452

» запутался с решением)
Сб Мар 04, 2017 12:34 am автор Tem

» задачи
Пн Фев 27, 2017 6:57 am автор Tem

» Многоатомные спирты
Чт Фев 23, 2017 1:17 am автор эл

» Запрос
Ср Фев 22, 2017 7:01 pm автор Admin

» Химия. Тесты для самоконтроля
Вт Фев 21, 2017 2:17 pm автор Aktam28.06

» Тест по теме"Предельные углеводороды" с ответами
Сб Фев 18, 2017 9:46 pm автор vella

» Тест по теме"Ароматические углеводороды" с ответами
Сб Фев 18, 2017 9:33 pm автор vella

» Межрегиональная предметная олимпиада Казанского федерального университета по предмету «Химия».2013-2014 уч.год
Сб Фев 18, 2017 11:55 am автор Aktam28.06

» Халиуллин Р.Ш. и др. Олимпиадные задания по предмету "Химия"
Сб Фев 18, 2017 2:16 am автор Aktam28.06

» Gemcom.Surpac.v6.5.1
Сб Фев 11, 2017 6:42 am автор PRIZ

» FX ChemStruct 1.105 - Русская версия
Чт Фев 09, 2017 5:44 pm автор vella

» Троегубова Н.П.Контрольно-измерительные материалы. Химия. 11 класс
Пн Фев 06, 2017 7:59 pm автор Fallen

» Тест по теме Спирты и фенолы
Ср Янв 25, 2017 9:06 pm автор кардинал

Часы и календарь
гороскоп
Кто сейчас на форуме
Сейчас посетителей на форуме: 30, из них зарегистрированных: 2, скрытых: 0 и гостей: 28 :: 2 поисковых систем

im, max92

Больше всего посетителей (799) здесь было Ср Фев 15, 2012 9:20 pm
Страны
Статистика
Всего зарегистрированных пользователей: 44213
Последний зарегистрированный пользователь: max92

Наши пользователи оставили сообщений: 14490 в 9527 сюжете(ах)
Самые активные пользователи
vella (2576)
 
Admin (1990)
 
кардинал (1918)
 
Rus (1489)
 
Линда (1192)
 
Deza (645)
 
robert (471)
 
alhimik (278)
 
Shushi (236)
 
Oxygenium (185)
 

Счётчик от яндекса
Яндекс.Метрика
популярные пользователи


Decon2LS

Перейти вниз

Decon2LS

Сообщение автор кардинал в Пн Мар 22, 2010 3:52 pm

Decon2LS: пакет с открытым исходным кодом программное обеспечение для автоматизированной обработки и визуализации данных с высокой разрешающей спектрометрией

Navdeep Jaitly1 , Anoop Mayampurath1 , Kyle Littlefield1 , Joshua N Adkins2 , Gordon A Anderson2  and Richard D Smith2

1  
Environmental Molecular Science Laboratory, Pacific Northwest National Laboratory, Richland, WA, 99352, USA

2  
Fundamental and Computational Sciences Directorate, Pacific Northwest National Laboratory, Richland, WA, 99352, USA

Аннотация

Фон

[Вы должны быть зарегистрированы и подключены, чтобы видеть это изображение]

Данные, полученные из жидкой хроматографии высокого разрешения масс-спектрометрии (LC-MS)-проведенных на базе биологического образца может содержать большое количество биологически значимой информации в виде белков, пептидов и метаболитов.
В этой статье мы опишем Decon2LS, пакет с открытым исходным кодом программное обеспечение для автоматизированной обработки и визуализации с высоким разрешением MS данных.Основаннная на обширных алгоритмах, разработанных за последние десять лет ICR2LS, Decon2LS пакет  алгоритмов  содержит богатый набор модулей, таких, как чтение исходных данных, рутинный поиск пика, теоретическое моделирования распределения изотопов и deisotoping.
Кроме того, Decon2LS предоставляет широкий набор средств визуализации, таких как высокий контроль графика работы.

[Вы должны быть зарегистрированы и подключены, чтобы видеть это изображение]

Результаты

Со множеством вариантов, которые включают пик активности, deisotoping, изотопный состав, и т.д., Decon2LS поддерживает обработку нескольких сырых форматов данных. Deisotoping могут быть выполнены по индивидуальному сканирования отдельных данных, или для нескольких наборов при  пакетной обработке. Другие варианты обработки включают создание двумерной жидкостной хроматографии (LC) функции элюции времени, создание спектра файлов для тандема данных MS, создание общих хроматограмм интенсивности и визуализации теоретических профилей пептида. Применение Decon2LS к deisotope различных наборов данных полученных через различные инструменты дают большое количество функций, которые могут быть использованы для идентификации и количественной оценки пептидов в биологическом образце.

[Вы должны быть зарегистрированы и подключены, чтобы видеть это изображение]

Заключение

Decon2LS является эффективным пакетом программного обеспечения для обнаружения и визуализации функций в протеомике исследованиях, связанных с автоматизированной интерпретацией  масс-спектров. Помимо того, она проста в использовании, быстра и надёжна.
Decon2LS исходный код, программу установки, и учебники можно скачать бесплатно на

[Вы должны быть зарегистрированы и подключены, чтобы видеть эту ссылку]


Загрузить программное обеспечение(4,6 Мв):

 http://omics.pnl.gov/installers/Decon2LS_Installer.zip

Загрузить учебник:

[Вы должны быть зарегистрированы и подключены, чтобы видеть эту ссылку]


Загрузить исходный код(104 Мв):

[Вы должны быть зарегистрированы и подключены, чтобы видеть эту ссылку]
avatar
кардинал
Модератор
Модератор

Сообщения : 1918
Дата регистрации : 2009-08-10
Место жительства : Из далека...

Вернуться к началу Перейти вниз

Вернуться к началу


 
Права доступа к этому форуму:
Вы не можете отвечать на сообщения