Бутырская Е. В. Компьютерная химия: основы теории и работа с программами Gaussian и GaussView

[Вы должны быть зарегистрированы и подключены, чтобы видеть эту ссылку]
[Вы должны быть зарегистрированы и подключены, чтобы видеть это изображение]
Автор: Е.В.Бутырская
Название: Компьютерная химия: основы теории и работа с программами Gaussian и GaussView
Год: 2011
Издательство: Солон-пресс
Страниц: 224
ISBN: 978-5-91359-095-4
Отрасль (жанр): Информационные технологии. Руководства по пользованию программами
Формат: DJVU
Качество: Хороший скан

Описание:
Монография является первым в отечественной литературе руководством по работе с программными комплексами Gaussian и Gaussview. Рассмотрены теоретические основы методов квантовой химии.

Кратко описаны не эмпирические и полуэмпирические методы решения электронного уравнения Шредингера, системы базисных функций, методы расчета термодинамических свойств системы, модели сольватации, теория ядерного магнитного резонанса, методы молекулярной механики и молекулярной динамики.
Приведено большое число примеров расчета структуры и свойств молекул и анализа полученных результатов с использованием указанных программ.
Предназначена для студентов, аспирантов и научных работников химических, физических и биологических специальностей вузов.

Содержание
Предисловие 3
Глава I. Теоретические основы вычислительных методов
квантовой химии 4
. 1 Разделение электронного и ядерного движений в молекулах 4
.2. Метод молекулярных орбиталей. Метод Хартри-Фока 9
.3 Метод Хартри-Фока-Рутана 27
.4 Наборы базисных функций 32
.5. Электронная плотность, порядки связей, заряды на атомах,
поляризуемость 36
.6 Электронная корреляция и неограниченный метод ХФ(ХФР) 40
.7 Метод взаимодействия конфигураций 42
.8 Теория возмущений Меллера-Плессета (MP) 43
.9 Молекула водорода 43
. 10 Теория функционала плотности 48
.11 Полуэмпирические методы квантовой химии 59
.12 Поверхность потенциальной энергии многоатомной молекулы 70
.13. Классификация стационарных точек на поверхности
потенциальной энергии. Путь химической реакции 71
. 14 Энергия нулевых колебаний (ZPE) 74
. 15 Сумма по состояниям системы 74
.16. Термодинамические функции состояния 76
.17 Вычисление суммы по состояниям для поступательного
движения 79
18 Формулы, выражающие термодинамические функции
через сумму по состояниям 80
.19 Сумма по состояниям внутренних движений молекулы 82
.20 Модели сольватации 84
.21 Ядерный магнитный резонанс. Метод GIAO 88
.22 Методы молекулярной механики 95
.23 Метод молекулярной динамики 98
Глава П. Основы работы с программой Gaussian под WINDOUS
2.1 Возможности программы Gaussian и ее структура 100
2.2. Запуск программы Gaussian для операционной
системы WINDOWS 103
2.3 Задание исходной конфигурации молекулы 108
2.4. Расчет энергии молекулы для фиксированной конфигурации 112
2.5 Управление процессом самосогласования 115
2.7. Построение базисных функций и молекулярных орбиталей 121
2.8. Расчет частот нормальных колебаний и термодинамических
свойств молекул 126
2.9 Сканирование поверхности потенциальной энергии 131
2.10. Поиск переходных состояний и расчет пути
химической реакции 132
2.11 Расчет спектров ЯМР 137
2.12. Расчет эффектов сольватации 139
2.13 Расчет возбужденных состояний 140
2.14 Ключевые слова программы 141
2.15 Примеры входных файлов программы Gaussian
Глава III. Основы работы с программой Gaussview 171
3.1. Старт программы Gaussview 171
3.2. Кнопки элементов и молекулярных фрагментов
на контрольной панели 172
3.3. Использование мыши. Просмотр и регулировка параметров
структуры 174
3.4 Расположение активных окон на рабочем столе 177
3.5 Стандартные кнопки ввода - вывода. Редактор списка атомов 177
3.6. Регулировка качества структуры молекулы в активном окне 178
3.7 Запуск программы Gaussian и просмотр
результатов с помощью программы Gaussview 182
3.8 ONIOM расчет молекулярных структур 188
3.9 Анализ результатов сканирования поверхности потенциальной
энергии с помощью программы Gaussview 190
3.10 Просмотр орбитальных энергий в программе Gaussview 192
3.11 Изображение молекулярных орбиталей
в программе Gaussview 193
3.12 Изображение ИК спектров молекул с помощью
программы Gaussview 201
3.13 Изображение спектров ЯМР в программе Gaussview 204
Аббревиатура методов компьютерной химии 209
Литература 211
Содержание 217